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College of Biological Science and Engineering

洪晓昆

发布日期:2023-08-27 发布者:

姓名:洪晓昆

性别:


职称:校聘副研究员,硕士生导师

学历:博士研究生

电子邮件:hongxk@fzu.edu.cn

研究方向:生物信息学,酶分子工程

研究生招生专业:生物工程(学硕)、生物技术与工程(专硕)

教育工作经历:

2023年8月-至今:争霸8官方入口 | 争霸8官方入口

2018年9月-2023年6月:上海交通大学 |系统生物医学研究院 | 生物学 | 博士

2015年8月-2018年6月:中山大学 | 生命科学学院 | 动物学 | 硕士

2011年9月-2015年6月:争霸8官方入口 | 争霸8官方入口 | 生物工程 | 本科

教学简介:

本科生课程:暂无

研究生课程:暂无

科研简介:

针对医药、化工等行业中具有重要应用前景的药物,基于计算生物学、人工智能和结构生物学的方法,对关键酶分子进行理性设计,并进行分子改造,以期提高酶立体/化学选择性、药物产量以及减少副产物等。

主持科研项目:

争霸8官方入口科研启动基金(2023-2025,主持)

代表性论文:

1. Hong X, Li N, Lv J, Zhang Y, Li J*, Zhang J*, Chen HF*. PTMint database of experimentally verified PTM regulation on protein-protein interaction. Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1):btac823. (JCR 1)

2. Hong X, Song K, Rahman MU, Wei T, Zhang Y, Da LT*, Chen HF*. Phosphorylation Regulation Mechanism of β2 Integrin for the Binding of Filamin Revealed by Markov State Model. J Chem Inf Model. 2023 Jan 23;63(2):605-618. (JCR 1)

3. Hong X, Lv J, Li Z, Xiong Y, Zhang J*, Chen HF*. Sequence-based machine learning method for predicting the effects of phosphorylation on protein-protein interactions. Int J Biol Macromol. 2023 Jul 15;243:125233. (JCR 1)

4. Hong X#, Guo T#, Xu X*, Lin J*. Multiplex metabolic pathway engineering of Monascus pilosus enhances lovastatin production. Appl Microbiol Biotechnol. 2023 Nov;107(21):6541-6552 (JCR 1)

5. Hong X#, Liu X#, Su B*, Lin J*. Improved Antimicrobial Activity of Bovine Lactoferrin Peptide (LFcinB) Based on Rational Design. Protein J. 2023 Aug 11 (JCR 3)

6. Hong XK#, Zhang X#, Fusco OA, Lan YG, Lun ZR*, Lai DH*. PCR-based identification of Trypanosoma lewisi and Trypanosoma musculi using maxicircle kinetoplast DNA. Acta Trop. 2017 Jul;171:207-212. (JCR 2)

7. Li W#, Wang D#, Hong X, Shi J, Hong J, Su S, Loaiciga CR, Li J, Liang W, Shi J*, Zhang D. Identification and validation of new MADS-box homologous genes in 3010 rice pan-genome. Plant Cell Rep. 2023 Jun;42(6):975-988. (JCR 1)

8. Li X, Xu Z, Hong X, Zhang Y*, Zou X*. Databases and Bioinformatic Tools for Glycobiology and Glycoproteomics. Int J Mol Sci. 2020 Sep 14;21(18):6727. (JCR 1)

9. Zhang X, Hong XK, Li SJ, Lai DH, Hide G, Lun ZR*, Wen YZ*. The effect of normal human serum on the mouse trypanosome Trypanosoma musculi in vitro and in vivo. Exp Parasitol. 2018 Jan;184:115-120. (JCR 3)

10. Lai DH, Hong XK, Su BX, Liang C, Hide G, Zhang X, Yu X, Lun ZR*. Current status of Clonorchis sinensis and clonorchiasis in China. Trans R Soc Trop Med Hyg. 2016 Jan;110(1):21-7. (JCR 3)


授权专利情况:

1. 赖德华,洪晓昆,张玄,温砚子,伦照荣。一种检测路氏锥虫的引物对和试剂盒。ZL 2017 1 0081801.9

2. 赖德华,洪晓昆,张玄,温砚子,伦照荣。一种检测小鼠锥虫的引物对和试剂盒。ZL 2017 1 0081625.9


授权软件著作权情况:

1. 陈海峰,洪晓昆。翻译后修饰调控蛋白互作的数据查询系统【简称:PTMint】。2022SR1528851

2. 陈海峰,洪晓昆。磷酸化修饰调控蛋白互作的人工智能预测系统【简称:PhosPPI】。2023SR0399360

获奖情况:

1. 上海交通大学优秀毕业生 (2023)

2. 硕士研究生国家奖学金 (2017)

3. 有害生物控制与资源利用国家重点实验室“杰出研究生奖”(2017)

4. 有害生物控制与资源利用国家重点实验室“优秀研究生奖”(2016)

5. 争霸8官方入口本科生优秀毕业设计(论文)(2015)

其他


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