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College of Biological Science and Engineering

洪晓昆

发布日期:2023-08-27 发布者:

姓名:洪晓昆

性别:


职称:副研究员(校聘)/硕士生导师

学历:博士研究生

电子邮件:hongxk@fzu.edu.cn

研究方向:生物信息学、酶分子工程

研究生招生专业:生物工程(学硕)、生物技术与工程(专硕)

教育工作经历:

2023年8月-至今:争霸8官方入口 | 争霸8官方入口

2018年9月-2023年6月:上海交通大学 | 系统生物医学研究院 | 生物学 | 博士

2015年8月-2018年6月:中山大学 | 生命科学学院 | 动物学 | 硕士

2011年9月-2015年6月:争霸8官方入口 | 争霸8官方入口 | 生物工程 | 本科

教学简介:



科研简介:

1. 蛋白质磷酸化修饰的功能研究。

蛋白质磷酸化修饰是蛋白质最广泛、最重要的翻译后修饰之一。蛋白质修饰能够通过调控蛋白质的结构和功能,从而参与疾病的发生发展。解析磷酸化修饰的功能,有助于加深对疾病发生发展机制的理解,为后续药物研发提供了指导。

2. 酶分子理性设计与改造。

酶分子是绿色合成生物学的关键。通过结构生物学、人工智能和生物信息学等方法对酶分子进行理性设计与改造,实现对高价值药物及中间体的规模化制备。与化学合成相比,节省了成本,并且绿色无污染。

主持科研项目:


代表性论文:

1. Hong X, Li N, Lv J, Zhang Y, Li J*, Zhang J*, Chen HF*. PTMint database of experimentally verified PTM regulation on protein-protein interaction. Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1):btac823.

2. Hong X, Song K, Rahman MU, Wei T, Zhang Y, Da LT*, Chen HF*. Phosphorylation Regulation Mechanism of β2 Integrin for the Binding of Filamin Revealed by Markov State Model. J Chem Inf Model. 2023 Jan 23;63(2):605-618.

3. Hong X, Lv J, Li Z, Xiong Y, Zhang J*, Chen HF*. Sequence-based machine learning method for predicting the effects of phosphorylation on protein-protein interactions. Int J Biol Macromol. 2023 Jul 15;243:125233.

4. Hong X#, Guo T#, Xu X*, Lin J*. Multiplex metabolic pathway engineering of Monascus pilosus enhances lovastatin production. Appl Microbiol Biotechnol. 2023 Nov;107(21):6541-6552.

5. Hong X#, Liu X#, Su B*, Lin J*. Improved Antimicrobial Activity of Bovine Lactoferrin Peptide (LFcinB) Based on Rational Design. Protein J. 2023 Dec;42(6):633-644.

6. Hong XK#, Zhang X#, Fusco OA, Lan YG, Lun ZR*, Lai DH*. PCR-based identification of Trypanosoma lewisi and Trypanosoma musculi using maxicircle kinetoplast DNA. Acta Trop. 2017 Jul;171:207-212.

授权专利情况:

1. 赖德华,洪晓昆,张玄,温砚子,伦照荣。一种检测路氏锥虫的引物对和试剂盒。ZL 2017 1 0081801.9

2. 赖德华,洪晓昆,张玄,温砚子,伦照荣。一种检测小鼠锥虫的引物对和试剂盒。ZL 2017 1 0081625.9


授权软件著作权情况:

1. 陈海峰,洪晓昆。翻译后修饰调控蛋白互作的数据查询系统【简称:PTMint】。2022SR1528851

2. 陈海峰,洪晓昆。磷酸化修饰调控蛋白互作的人工智能预测系统【简称:PhosPPI】。2023SR0399360

获奖情况:

1. 上海交通大学优秀毕业生 

2. 硕士研究生国家奖学金 

3. 争霸8官方入口本科生优秀毕业设计(论文)

其他


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